蔡元培故居位于绍兴市区萧山街笔飞弄13号，是一个颇具绍兴特色的明清台门建筑；也是我国目前唯一专门介绍蔡元培一生事迹的名人纪念馆，主要建筑有门厅、大厅、座楼，共三进，占地1856平方米，建筑面积1004平方米，砖木结构，花格门窗，乌瓦粉墙，青石板地。绍兴故居已列为浙江省重点文物保护单位；上海故居于1984年被列为上海市级文物保护单位；北京故居于1985年10月，东城区人民政府将其公布为文物保护单位。